Кафедра физиологии и микробиологии образована согласно решению Учёного Совета филиала МГУ им.М.В.Ломоносова в  1992 году. Заведующей кафедрой была назначена Татьяна Петровна Генинг - доктор биологических наук, профессор, академик РАЕН. 

В сентябре 1992 года кафедра приступила к преподаванию курса нормальной физиологии человека студентам 2-го курса медицинского факультета. С февраля 1993 года кафедра начала преподавание второй учебной дисциплины – медицинской микробиологии.

В составе кафедры были к.б.н., доцент Михайлова Н.Л., к.б.н. ст.преподаватель Крикунова Н.А., к.м.н., доцент Потатуркина-Нестерова Н.И., ст.преподаватель Кулагина Г.М., зав.кабинетами Грешнова Л.М., ст.лаборанты Кондратьева Р.П., Чебан Н.М.

В 2003 году кафедра преобразована в кафедру физиологии и патофизиологии с добавлением курса патологической физиологии и передачей курса микробиологии на экологический факультет института.

На кафедре сформированы материально-техническая и учебно-методическая базы для  учебного процесса по дисциплинам:

• нормальная физиология человека;
• физиология висцеральных систем;
• психофизиология;
• нейрофизиология;
• физиология с основами анатомии
• физиология ВНД;
• физиология животных
• патологическая физиология;
• клиническая патофизиология.